O Programa INTERREG V-A Espanha-Portugal (POCTEP) 2014-2020 é o resultado direto da experiência favorável que, desde 1989, envolveu a cooperação na fronteira entre os dois países, que permitiu e pretende continuar a avançar na melhoria da qualidade de vida dos habitantes do Espaço de Cooperação.

A CCDR-N integra o Comité de Gestão do Programa, responsável pela coordenação e acompanhamento, a nível processual e financeiro, dos Programas de Cooperação Transfronteiriça, com incidência regional. Neste âmbito assume tarefas relacionadas com a análise e valoração das candidaturas existentes ao longo da execução dos Programas; validação de despesas dos pedidos de pagamento submetidos; elaboração e divulgação dos procedimentos e normas relacionados com o acompanhamento financeiro e processual dos Programas e apoio à atividade dos Comités Territoriais Galiza/Norte de Portugal e Castela e Leão/Norte de Portugal, nomeadamente através da preparação das reuniões e propostas de decisão a submeter a estes órgãos regionais, bem como aos Comités de Gestão e de Acompanhamento, em articulação com o respetivo Secretariado Técnico.​

A CCDR-N é, ainda, entidade beneficiária nos projetos GEOARPAD, AECT-GNP, CRECEER, GERÊS-XURÉS, NORCYL 2020, ARIEM + e IMPACT RIS3T.